理化学研究所（理研） 開拓研究本部 新宅マイクロ流体工学理研白眉研究チームの新宅 博文理研白眉研究チームリーダー、マハメッド・ナディ・アブデルモエズ 研修生、東京大学 大学院理学系研究科の小口 祐伴 特任助教、上村 想太郎 教授、京都大学 大学 ...

皆さんは日々増加するRNA-seqデータの解析に、どのようなツールを使っていますか？ 従来のツールでは複数サンプルを同時に分析する際に精度や効率の問題を抱えていませんか？ 本記事では、機械学習を活用した次世代RNA-seqアセンブラー「Aletsch（アレッチ ...

RNA-seq解析を始めようとすると、最初に直面する重要な選択があります。 「どのマッピングツールを使うべきか？」 HISAT2？ STAR？ それともSalmonやKallistoのような疑似アライメントツール？ この選択は研究結果の質、計算時間、必要なコンピュータリソースに ...

－1細胞完全長トータルRNAシーケンス法の開発に成功－ 要旨 理化学研究所（理研）情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニットの林哲太郎センター研究員、尾崎遼基礎科学特別研究員、二階堂愛ユニットリーダーらの研究チーム ※ は ...

理化学研究所（理研）生命医科学研究センタートランスクリプトーム研究チームのアレッサンドロ・ボネッティ客員研究員、ピエロ・カルニンチチームリーダーらの研究チームは、細胞核内のRNAとゲノムDNA（クロマチン[1] ）の相互作用をゲノム全体で調べる ...

転写適応は、重要な遺伝子の機能喪失変異を持つ生物個体が、時に生存し、さらに、健全に成長する一因とされているが、そのプロセスはあまり解明されていない。MITのJonathan S. Weissman 教授とHarvard society of fellowsのMohamed El-Brolosy博士が率いる研究チームが今 ...

生命科学の研究方法として、「シングルセル（単一細胞）解析」が大きな注目を浴びている。臓器に含まれる細胞を個別に解析していく研究方法であり、細胞集団を解析して平均値を捉えるこれまでの手法では見逃されてきた新しい細胞種、また、これまで ...

ゲノム解析サービスを提供する株式会社ジエンブル（本社：福岡県福岡市、代表取締役：竹添裕高）は、理化学研究所（埼玉県和光市 理事長：五神 真、以下理研） 生命機能科学研究センター バイオインフォマティクス研究開発チームら共同研究チームが ...

Craif株式会社（所在地：東京都文京区、CEO：小野瀨 隆一、以下Craif）は、第9回 Liquid Biopsy研究会にて、慶應義塾大学医学部泌尿器科学教室の馬場優人特任助教らとの泌尿器がん（前立腺がん、尿路上皮がん、腎細胞がん）に関する研究成果「尿中エクソソー ...