空間トランスクリプトミクス技術には、場合によっては個々の測定結果に複数の細胞の寄与が含まれ、局在性と発現に関する細胞タイプ特異的な空間パターンの発見が妨げられるという制約がある。今回我々は、単一細胞RNA塩基配列解読データから学習した ...
Welcome to RCTD, an R package for learning cell types and cell type-specific differential expression in spatial transcriptomics data. RCTD inputs a spatial transcriptomics dataset, which consists of a ...
Note: The spacexr package is now available on Bioconductor. Instructions for using the Bioconductor package can be found here. At the time of writing, the Bioconductor version only implements RCTD, so ...