生命科学の研究方法として、「シングルセル（単一細胞）解析」が大きな注目を浴びている。臓器に含まれる細胞を個別に解析していく研究方法であり、細胞集団を解析して平均値を捉えるこれまでの手法では見逃されてきた新しい細胞種、また、これまで ...

シングルセルRNA-seqデータからもとの細胞種を同定する、深層学習を用いた新しい手法scDeepInsightを提案しました。 1細胞ごとの発現データを前処理後に画像化することにより、深層学習が持つ画像分類や特徴抽出の利点を最大限に活用できます。それに ...

東京大学大学院 新領域創成科学研究科のジア シャンルー 大学院生、理化学研究所 生命医科学研究センターのアロック シャルマ 専任研究員、東京大学大学院 理学系研究科のアルテム ルイセンコ 助教、角田 達彦 教授らによる研究グループは、シングル ...

〜シングルセルRNA-seq解析および空間トランスクリプトーム解析技術を統合した最先端の手法により解明〜 東京慈恵会医科大学総合医科学研究センター次世代創薬研究部の藤田雄准教授、同大学内科学講座呼吸器内科の渡邉直昭助教、平野悠太助教、吉田 ...

〜シングルセルRNA-seq解析および空間トランスクリプトーム解析技術を統合した最先端の手法により解明〜 東京慈恵会医科大学総合医科学研究センター次世代創薬研究部の藤田雄准教授、同大学内科学講座呼吸器内科の渡邉直昭助教、平野悠太助教、吉田 ...

理化学研究所（理研）生命機能科学研究センターバイオインフォマティクス研究開発チームの笹川洋平上級研究員、田中かおりテクニカルスタッフI（研究当時）、林哲太郎技師、二階堂愛チームリーダーの研究チームは、「高出力型1細胞RNA[1]シーケンス法[2 ...

A comprehensive review article titled “Bioinformatics perspectives on transcriptomics: A comprehensive review of bulk and single-cell RNA sequencing analyses,” published in Quantitative Biology, ...

ゲノム解析サービスを提供する株式会社ジエンブル（本社：福岡県福岡市、代表取締役：竹添裕高）は、理化学研究所（埼玉県和光市 理事長：五神 真、以下理研） 生命機能科学研究センター バイオインフォマティクス研究開発チームら共同研究チームが ...